实验室固定人员杜联明博士在生物信息学领域顶级期刊《Briefings in Bioinformatics》(JCR Q1,影响因子13.994)上发表题为“Dockey: a modern integrated tool for large-scale molecular docking and virtual screening”的最新研究成果。本研究由杜联明博士和实室副主任赵克雷博士合作完成,杜联明博士为论文第一作者,赵克雷博士为通讯作者。
分子对接技术是一种重要的计算机辅助药物设计方法,通过计算模拟受体与配体之间相互作用预测结合构象进行药物虚拟筛选,广泛应用于药物发现和药物再利用。本研究基于广泛使用的分子对接工具AutoDock,开发了一款界面友好、跨平台的批量分子自动对接系统Dockey,实现了分子对接的完整流程自动化,包括分子数据清洗、受体与配体准备、批量对接、受体-配体相互作用分析、对接构象3D结构可视化等,并且可以同时运行多蛋白与药物数据库进行高通量筛选,无需操作人员掌握计算机语言,为药物虚拟筛选提供了简便、快捷、易操作的重要工具。
原文链接:https://doi.org/10.1093/bib/bbad047