碳青霉烯类抗生素耐药家族成员之一CIM-1的鉴定与表征
作者:陶洪坤 时间:2024-05-16 点击数:
医疗环境中碳青霉烯耐药细菌的增加率是一个非常值得关注的问题,需要紧急关注。这种耐药性是由 MBLs驱动的,它可以催化几乎所有临床可用的β-内酰胺的水解,并且对所有临床使用的β-内酰胺酶抑制剂具有耐药性。
2024年3月,Yu Wang等人在Communications Biology(IF=5.63)上发表了题为“Identification and characterization of CIM-1, a carbapenemase that adds to the family of resistance factors against last resort antibiotics”的研究论文。在这项研究中,在机会致病菌Chryseobacterium indologenes的多重耐药株中发现了未表征的MBL。序列分析预测该它具有非典型脂盒的脂蛋白。CIM-1的特性表明它是一种高亲和力的碳青霉烯酶,具有广谱活性,包括所有头孢菌素和碳青霉烯类。结果还表明,CIM-1可能是具有未表征脂盒的膜相关MBL。使用预测工具,还发现了更多具有非典型脂盒的潜在脂化MBLs,强调了进一步研究脂化MBLs的必要性。
图1 结构示意图和重要氨基酸分析。a脂蛋白的生物合成。(1)二酰基甘油酯部分通过硫醚键连接到Cys的巯基上;(2)信号肽的裂解;(3)酰基甘油酯连接到Cys的游离氨基上。红色:脂盒,橙色:信号肽n端序列。B.CIM-1与NDM-1脂盒序列比较。c本研究中设计和评估的结构示意图。d ' +2 '规则和CIM-1和NDM-4中高度保守的Cys后的氨基酸。
图2 结构的示意图及其假设的细胞定位
图3 a 在C. indologenes中鉴定了一种未表征的金属β-内酰胺酶。CIM-1(登录号:WP_123865086.1)与NDM-1的氨基酸序列比对,NDM-1与CIM-1序列同源性为33.5%。锌配位体用黑色三角形表示。b 基于M. odoratimimus的MYO-1 (PDB: 6T5L) MBL生成的CIM-1三维模型。蓝色残基表示对生成的模型具有很高的置信度。红色残差表示置信度较低。c SWISS-MODEL生成的CIM-1三维结构中的锌结合残基。
原文链接:https://www.nature.com/articles/s42003-024-05940-0
DOI: 10.1038/s42003-024-05940-0